Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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