Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCOF1Q13428 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCOF1Q13428 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
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