Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SP140Q13342 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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