Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SKP2Q13309 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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