Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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