Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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