Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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