Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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