Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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