Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms