Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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