Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms