Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FOXD4Q12950 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FOXD4Q12950 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FOXD4Q12950 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FOXD4Q12950 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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