Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN2AQ12879 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms