Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GTF3C1Q12789 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1Q12789 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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