Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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