Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms