Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCRN3Q0VDG4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCRN3Q0VDG4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCRN3Q0VDG4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCRN3Q0VDG4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCRN3Q0VDG4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCRN3Q0VDG4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms