Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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