Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms