Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms