Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms