Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms