Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms