Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms