Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms