Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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