Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHC1P78364 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms