Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB15P59190 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB15P59190 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB15P59190 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB15P59190 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB15P59190 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB15P59190 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms