Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms