Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms