Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP3P57721 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms