Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms