Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms