Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms