Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM4P49221 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM4P49221 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM4P49221 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM4P49221 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM4P49221 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGM4P49221 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGM4P49221 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM4P49221 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM4P49221 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms