Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOLR3P41439 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms