Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms