Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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