Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPREP23469 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPREP23469 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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