Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHP20396 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHP20396 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHP20396 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms