Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL2P19875 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms