Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD53P19397 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms