Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF3P18847 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF3P18847 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms