Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms