Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTLA4P16410 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTLA4P16410 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTLA4P16410 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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