Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB1P16220 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms