Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms