Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms