Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTA1P02549 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTA1P02549 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms